根据《高新技术企业认定管理办法》（以下称《认定办法》）和《国家重点支持的高新技术领域》（以下称《重点领域》）的规定，为明确高新技术企业认定管理工作中各相关单位的职责，确定企业研究开发活动及费用归集标准，明晰各指标内涵及其测度方法，确保认定管理工作规范、高效地开展，特制定《高新技术企业认定管理工作指引》（以下称《工作指引》）。各相关单位应依据《认定办法》、《重点领域》，结合本《工作指引》，开展高新技术企业认定管理工作。

依照《认定办法》、《重点领域》，结合本《工作指引》所认定的高新技术企业即为《中华人民共和国企业所得税法》（以下称《企业所得税法》）第二十八条所称国家需要重点扶持的高新技术企业。

一、领导小组和认定机构

科技部、财政部、税务总局组成全国高新技术企业认定管理工作领导小组（以下称“领导小组”），领导小组下设办公室（设在科技部火炬高技术产业开发中心），负责处理日常工作。

省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政部门、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构（以下称“认定机构”），认定机构下设办公室（设在省级、计划单列市科技行政主管部门），由科技、财政、税务部门相关人员组成，负责处理日常工作。

领导小组和办公室及认定机构的主要职责见《认定办法》。

二、认定与申请享受税收政策的有关程序

（一）认定

1．自我评价。企业应对照《认定办法》第十条进行自我评价。认为符合条件的在“高新技术企业认定管理工作网”（网址：www.innocom.gov.cn）进行注册登记。

2．注册登记。企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，按要求填写《企业注册登记表》（附1），并通过网络系统上传至认定机构。

认定机构应及时完成企业身份确认并将用户名和密码告知企业。

3．准备并提交材料。企业根据获得的用户名和密码进入网上认定管理系统，按要求将下列材料提交认定机构：

（1）《高新技术企业认定申请书》（附2）；

（2）企业营业执照副本、税务登记证书（复印件）；

（3）经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用（实际年限不足三年的按实际经营年限）、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告；

（4）经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）；

（5）技术创新活动证明材料，包括知识产权证书、独占许可协议、生产批文，新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告，省级（含计划单列市）以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料。

4．组织审查与认定

（1）认定机构收到企业申请材料后，按技术领域从专家库中随机抽取不少于5名相关专家，并将电子材料（隐去企业身份信息）通过网络工作系统分发给所选专家。

（2）认定机构收到专家的评价意见和中介机构的专项审计报告后，对申请企业提出认定意见，并确定高新技术企业认定名单。

上述工作应在收到企业申请材料后60个工作日内完成。

5．公示及颁发证书

经认定的高新技术企业，在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日。公示有异议的，由认定机构对有关问题进行查实处理，属实的应取消高新技术企业资格；公示无异议的，填写高新技术企业认定机构审批备案汇总表，报领导小组办公室备案后，在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并由认定机构颁发“高新技术企业证书”（加盖科技、财政、税务部门公章）。

具体认定流程如下图所示：

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网上申报操作指南

下载填报工具并安装

　　企业注册，获得填报号和注册文件

　　运行填报工具，导入注册文件

　　开始脱机填写申报内容

　　导出申报数据，在数据上传页面提交申报数据

　　打印纸质文件，按所属认定机构的要求递交（本环节在网下完成）

　　第一步：下载填报工具并安装

　　网址：高新技术企业认定管理工作网 https://www.innocom.gov.cn

　　下载：在该网址主页的办事流程栏目内，点击“申请”进入下载界面，点击“下载填报工具”即可下载

　　安装：文件解压缩后，得到ReaderSetUp2009.msi安装文件，点击安装即可

　　请注意安装该软件设置的默认路径安装！

　　第二步：企业注册（获得注册文件后，方可使用填报工具）

　　点击“获取注册文件”进行企业注册

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　　填写基本信息后提交即完成注册

　　注册信息修改和注册文件下载通过申报号在这个页面操作

　　第三步：导入注册文件

　　运行“高新技术企业认定申请填写工具”，选择“导入注册文件” ，按步骤操作即可导入注册文件。

第四步：脱机填写申报内容

　　保存数据：填写过程中及时保存数据，防止数据丢失

　　导出、导入数据 ：通过“导出数据”把数据文件导出，进行网上提交

　　校验数据 ：通过数据校验提示，填写错误的位置会以红色标记标出

　　增加新行及新页：在填写过程中，若需要增加/删除行数，单击鼠标右键，进行增加/删除行

　　正式打印 ：需要根据导出数据进行正式打印

　　第五步：网上提交

　　通过填报工具的“导出功能” 导出数据包

　　点击“提交数据”，浏览选择数据包文件进行提交即可

　　在受理前可重复提交，以最后数据为准

　　须保持网上数据和纸质申报数据一致

　　可自行通过网络查询提交结果

　　第六步：打印纸质文件

　　一定要根据导出的数据正式打印（导出之后会生成一个识别号 ）

　　打印的文件一定要以网上最后提交的数据为准

　　按照顺序装订

　　提交至市科技局

　　如果出现打印不完全，一是要检查打印机与驱动（一般采用激光打印机）；二是填写的数据中把多余的空格及换行去掉，用序号标识即可